Металлоинвест придает большое значение решению задач обеспечения экологической безопасности и минимизации воздействия производства на окружающую среду. В 2018 году компания инвестировала 1 млрд рублей в природоохранные мероприятия на Михайловском ГОКе.
В частности, реализовано отведение сточных вод промплощадки ремонтно-механического и автотракторного управлений в хвостохранилище. Ведется строительство насосной станции оборотного водоснабжения дробильно-сортировочной фабрики с целью полного прекращения сброса сточных вод в реку Рясник. В целом за последние три года сброс в водные объекты сокращен на 40%.
Для воспроизводства водных биологических ресурсов в 2018 году Михайловский ГОК приобрел и выпустил в Михайловское водохранилище на реке Свапа 49 750 шт. молоди сазана общей массой 995 кг.
Системную работу проводит компания «Металлоинвест» по снижению выбросов в атмосферный воздух, инвестируя в реконструкцию пылегазоочистных установок. В период с 2012 по 2018 годы на МГОКе выполнены мероприятия по модернизации пылеулавливающих установок на перегрузках открытых складов окатышей фабрики окомкования, на 4-х источниках выбросов установлены современные аппараты очистки воздуха. Комплекс экологических мероприятий МГОКа способствует соблюдению установленных нормативов на источниках выбросов и на границе санитарно-защитной зоны предприятия. По данным производственного контроля в 2018 году превышений предельно-допустимых концентраций (ПДК) веществ в атмосферном воздухе близлежащих населенных пунктов не установлено.
МГОК стремится минимизировать производственные отходы, с этой целью проводится замена масляных выключателей на вакуумные и элегазовые, ртутных ламп на светодиодные.
Эффективность природосберегающих мероприятий Михайловского ГОКа успешно подтверждается в ходе аудитов соответствия системы экологического менеджмента международному стандарту ISO 14001.
Металлоинвест инвестирует более 21 млрд руб в Экологическую программу 
Металлоинвест вложит более 21 млрд рублей в экологию 
Стойленский ГОК подвел итоги экологических мероприятий минувшего года 
Металлоинвест подвел итоги работы предприятий 
МГОК соответствует международным стандартам